Bất hoạt nhiễm sắc thể X (còn gọi là lyon hóa) là một quá trình mà một trong những bản sao của nhiễm sắc thể X bị bất hoạt ở một số động vật có vú [mà?]. Nhiễm sắc thể X không hoạt động được làm im lặng bởi nó được đóng gói theo cách mà nó có cấu trúc không hoạt động phiên mã được gọi là heterochromatin. Vì gần như tất cả các động vật có vú cái đều có hai nhiễm sắc thể X, bất hoạt X ngăn cản chúng có số lượng sản phẩm gen nhiễm sắc thể X gấp đôi so với nam giới, những người chỉ sở hữu một bản sao của nhiễm sắc thể X (xem phần bù liều). Sự lựa chọn nhiễm sắc thể X sẽ bị bất hoạt là ngẫu nhiên ở động vật có vú như người, nhưng một khi nhiễm sắc thể X bị bất hoạt, nó sẽ không hoạt động trong suốt vòng đời của tế bào và hậu duệ của nó trong cơ thể sinh vật. Không giống như bất hoạt X ngẫu nhiên ở động vật có vú ở nhau thai, bất hoạt ở thú có túi chỉ áp dụng cho nhiễm sắc thể X có nguồn gốc từ cha.